张岩科研成果

基本信息 科学研究 教学研究 论文著作 新建主栏目 基本信息 名称 多年来一直从事生物信息学、肿瘤信息学以及计算表观遗传学领域的科研工作。致力于表生物医学领域的高通量数据挖掘的算法和软件开发，可视化网络平台及数据库构建。科研成果在《Nucleic Acids Research》，《RNA Biology》、《Development》、《Epigenomics》、《Briefings in Bioinformatics》等有国际影响的杂志上发表了多篇论文。研究方向涉及到肿瘤生物学、发育生物学、比较基因组学等领域的基因组、表观基因组、转录组和代谢组学的数据分析、功能挖掘以及生物标记物的识别。 工作经历 标题 工作经历 起讫时间 2018/04- 至今 职位/职称 教授，博士生导师 工作单位 哈尔滨工业大学，生命科学与技术学院 简单介绍 标题 工作经历 起讫时间 2006/05- 2018/04 职位/职称 教授，博士生导师 工作单位 哈尔滨医科大学，生物信息科学与技术学院 简单介绍 教育经历 标题 学习经历 起讫时间 2003/04- 2006/03 所学专业 计算生物学 学习机构 日本国立新泻大学，自然科学研究科 学历 博士 简单介绍 标题 学习经历 起讫时间 2001/04- 2003/03 所学专业 计算生物学 学习机构 日本国立新泻大学，理学院 学历 硕士 简单介绍 标题 学习经历 起讫时间 1987/09- 1992/07 所学专业 临床医学 学习机构 哈尔滨医科大学 学历 本科 简单介绍 主要任职 任职名称 中国抗癌协会肿瘤标志专委会肿瘤测序与大数据分析专家委员会主任委员 任职时间 2019.12- 简单介绍 任职名称 中国细胞生物学会功能基因组学与系统生物学专委会理事 任职时间 2018.10 简单介绍 任职名称 中国计算机学会生物信息学专委会委员 任职时间 2017.10 简单介绍 任职名称 中国细胞生物学会生物数据挖掘与计算专业组委员 任职时间 简单介绍 任职名称 中国细胞生物学会功能基因组与系统生物学分会转化医学与生物信息学专委会委员 任职时间 简单介绍 任职名称 黑龙江生物医学工程学会理事 任职时间 简单介绍 任职名称 《基因组学与应用生物学》编委 任职时间 简单介绍 任职名称 《Plos One》学术编辑 任职时间 简单介绍 研究领域 名称 研究方向：生物信息学及计算生物学。包括表观基因组变异分析技术、基于生物信息学挖掘肿瘤的基因组特征、基于机器学习的癌症诊断和预后评估体系构建等研究方向 科研项目 项目名称 融合多组学高通量数据识别早期结肠癌预警及诊断的肿瘤标志物 项目来源 国家自然科学基金联合基金重点项目 开始时间 2021.01 结束时间 2024.12 项目经费 260万元 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 进行中 简单介绍 奖项成果 奖项名称 黑龙江省人民政府科学技术奖，二等奖（自然） 获奖时间 2017.06 完成人 张岩 所获奖项 癌症中异常DNA甲基化标记提取技术 简单介绍 讲授课程 名称 所讲的主要课程 《生物信息学》 《功能基因组信息学》 《生物信息挖掘技术》 《了解生物医学大数据》 《计算生物学》 招生信息 名称 本课题组招收生物医学工程（生物信息学方向）的硕士、博士研究生。欢迎数学、生物信息学、计算机科学、生命科学、软件工程、统计学等专业的本科、硕士毕业生报考攻读硕士、博士学位。 课题组广聘英才，欢迎数学、生物信息学、计算机科学、软件工程专业的博士毕业生来课题组从事博士后研究工作。 发表的论文 论文标题 SEA version 3.0: a comprehensive extension and update of the Super-Enhancer archive. 作者 Chen C, Zhou D, Gu Y, Wang C, Zhang M, Lin X, Xing J, Wang H, Zhang Y 发表时间 2020 Jan 期刊名称 Nucleic Acids Res. 2020 Jan 8;48(D1):D198-D203. 期卷 8;48(D1):D198-D203. 简单介绍 论文标题 DiseaseMeth version 2.0 作者 Xiong Y, Wei Y, Gu Y, Zhang S, Lyu J, Zhang B, Chen C, Zhu J, Wang Y, Liu H, Zhang Y* 发表时间 期刊名称 《Nucleic Acids Research》 期卷 4;45(D1):D888-D895 简单介绍 论文标题 DNA methylation dynamics: identification and functional annotation 作者 Liu H, Li S, Wang X, Zhu J, Wei Y, Wang Y, Wen Y, Wang L, Huang Y, Zhang B, Shang S, Zhang Y* 发表时间 期刊名称 《Brief Funct Genomics》 期卷 15(6):470-484. 简单介绍 论文标题 Cell subpopulation deconvolution reveals breast cancer heterogeneity based on DNA methylation signature 作者 Wen Y, Wei Y, Zhang S, Li S, Liu H, Wang F, Zhao Y, Zhang D, Zhang Y* 发表时间 期刊名称 《Briefing in Bioinformatics》 期卷 18(3):426-440 简单介绍 论文标题 The identification of age-associated cancer markers by an integrative analysis of dynamic DNA methylation changes 作者 Wang Y, Zhang J, Xiao X, Liu H, Wang F, Li S, Wen Y, Wei Y, Su J, Zhang Y, Zhang Y* 发表时间 期刊名称 《Sci Rep》 期卷 7;6:22723 简单介绍 论文标题 SEA: a comprehensive SuperEnhancer Archive 作者 Wei Y, Zhang S, Shang S, Zhang B, Wang X, Li S, Liu H, Zhang Y* 发表时间 期刊名称 《Nucleic Acids Research》 期卷 4;44(D1):D172-9 简单介绍 论文标题 Systematic identificationand annotation of human methylation marks based on bisulfite sequencing methylomes revealsdistinct roles of cell-type-specific hypomethylation in regulation of cell identify genes 作者 Liu H, Liu X, Zhang S, Lv J, Li S, Shang S, Jia S, Wei Y, Wang F, Su J , Zhang Y* 发表时间 期刊名称 《Nucleic Acids Research》 期卷 8;44(1):75-94 简单介绍 出版物 出版物名称 计算生物学 作者 张岩 出版时间 2023.09 出版社 科学出版社 简单介绍 出版物名称 《生物医学信息学》 作者 张岩 出版时间 2018 出版社 人民卫生出版社 简单介绍 出版物名称 《医学生物学》 作者 张岩 出版时间 2018 出版社 人民卫生出版社 简单介绍 出版物名称 《生物信息学》 作者 张岩 出版时间 2010 出版社 人民卫生出版社 简单介绍 出版物名称 《生物信息学与医学实践》 作者 张岩 出版时间 2012 出版社 人民卫生出版社 简单介绍