王亚东科研成果

基本信息 教学与研究方向 论文与论著 研究团队与平台 新建主栏目 基本信息 名称 现任哈尔滨工业大学教授、博士生导师、医学与健康学院执行院长、生物信息技术研究院院长、生物大数据教育部重点实验室主任、基因组大数据黑龙江省协同创新中心主任、国务院学位委员会学科评议组成员、政协黑龙江省第十一届委员会常委，长期从事以生物信息学、BT-IT融合科技研究，领导国内顶尖、国际有影响力的生物信息学研究团队。 主要教育与工作经历 名称 1982.09-1986.03 黑龙江大学计算机科学与工程系 获学士学位 1986.09-1989.03 哈工大计算机科学与技术系 获硕士学位 1989.03-1991.11 哈工大计算机科学与技术系 助教 1991.12-1996.06 哈工大计算机科学与技术系 讲师 1996.07-2001.04 哈工大计算机科学与技术系 副教授 2001.05-至今 哈工大计算机科学与技术学院 教授 2005.06-至今 哈工大计算机科学与技术学院 博士生导师 2001.08-2001.12 哈工大计算机科学与技术学院 院长助理 2001.12-2010.11 哈工大计算机科学与技术学院 副院长 2008.01-2009.01 美国印第安那大学/普渡大学 访问教授 2011.01-2020.12 哈工大计算机科学与技术学院 院长 2014.07-2020.12 哈工大软件学院 院长 2016.08-至今 哈工大生物信息技术研究院 院长 2019.01-至今 哈工大生物大数据教育部重点实验室 主任 2021.01-至今 哈工大医学与健康学院 执行院长 学术贡献 名称 王亚东教授是我国生物信息学领域的资深专家，于2002年在哈工大创立世界首个生物信息学本科专业，建立国际化生物信息学人才培养体系，开启我国生物信息学人才培养工作，迄今已为我国生物信息学及相关领域输送大量前沿人才。 近20年来，王亚东教授持续领导建设哈工大生物信息学团队，开展生物大数据分析、挖掘、转化、利用的核心技术研究，参与生物信息学与基因组科技领域国际前沿竞争。该团队现已经成为具有国内领先水平和较强国际影响力的生物信息学创新研究团队，是我国在该领域的“战略科技力量”，承担国家重大项目20余项（总经费超过5亿元）。其中代表性项目包括： 我国首个数字化医疗重大项目——“数字化医疗”项目（国家“863计划”，2012-2015）； 我国首个生物大数据技术重大项目——“生物大数据开发与利用”项目（国家“863计划”，2015-2017）； 我国首个大规模基因组计划——“中国十万人基因组计划”（ 国家重点研发计划“精准医学”专项，2018-2022）； 我国首个网络生物安全重大项目——“国家级生物信息平台关键技术研发”项目（国家重点研发计划“生物安全”专项，2017-2021）。 在一系列国家重大项目支持下，王亚东教授带领团队围绕基因组大数据分析研发上百项核心算法，在发表高水平期刊论文100余篇，产生专利与软件著作权50余项；特别是，首次实现我国在大规模基因组计划数据解析核心技术上的自主可控，成功实施“中国十万人基因组计划”，打造我国“生物数据海关”，为我国基因组科技、生物医药、生物安全等重要生物经济领域发展和“健康中国”建设奠定了重要科学基础，打造了“国之重器”。其中代表性成果包括： 主持完成我国首个大规模基因组计划——“中国十万人基因组计划”重大科技工程，绘制万分之一精度（世界最高精度）中国人基因组变异图谱，发现超2.9亿中国人基因组变异（其中超1.1亿新发现变异），国务院领导批示：“此事很有意义，对于实现从疾病防治为主向促进健康为主的健康中国建设提供了重要科学基础”； 建立大规模基因组序列非线性表示、索引与分析理论及算法，获2019年黑龙江省自然科学一等奖（项目名称：基因组大数据分析理论与方法研究）； 建立面向复杂疾病的多组学生物标志物挖掘系列方法，获2021年黑龙江省自然科学一等奖（项目名称：复杂疾病的生物信息处理与分析研究）、二等奖（项目名称：基因表达调控信息挖掘理论与方法研究）； 建立大规模网络生物数据分析技术体系，打造我国“生物数据海关”，获2021年中国通信学会科技进步一等奖（项目名称：面向超大规模流量的网络生物数据安全检测关键技术及应用）。 社会服务 名称 王亚东教授于2001年遴选担任国家“863”计划生物信息技术主题第一届专家组专家，是我国生物信息学领域最资深的专家之一，20余年来一直担任我国生物信息学、生物医药、基因组科学等重要前沿领域的战略科学家，其主要担任的专家工作如下： 国家生物技术发展战略指导专家委员会专家（2018-至今）； 科技创新2030 “健康保障工程”专家委员会专家（2017-至今）； 科创板科技创新咨询委员会专家（2019-至今）； 中国人类遗传资源创新技术联盟秘书长（2020-至今）； 中国人类遗传资源管理专家组专家（2019-至今）； 《中国人类遗传资源管理条例》立法组专家（2015-2019）； “十四五”“生物与信息融合”重点专项专家组专家（2021-至今）； “十三五”“生物安全”重点专项专家组专家（2015-至今）； “十三五”“重大慢病” 重点专项专家组专家（2015-至今）； “863”计划生物和医药领域委员会专家（2007-2010）； “863”计划生物信息技术主题第二届专家组专家（2003-2006）； “863”计划生物信息技术主题第一届专家组专家（2001-2003）。 作为战略科学家，王亚东教授规划、组织、实施数十项我国生物经济相关领域重大项目，并参与《中国人类遗传资源管理条例》编制工作，组建中国人类遗传资源创新技术联盟，为我国生物信息开发和国家生物安全保障做出一系列重大贡献。 主讲课程 名称 《新医学科学与技术导论》 《生物系统的信息学原理》 研究方向 名称 主要研究生物信息学、人工智能、知识工程、机器学习等。具体包括：基因组数据分析算法、数据可视化、知识挖掘与整合、网络分析、生物医药领域搜索等。 王亚东教授在我国较早从事生物信息学研究的专家之一，2002年在我国建立第一个经教育部批准的生物信息技术本科专业，并在哈工大计算机学院招收、培养我国第一批生物信息技术本科生；十五年来，推动了我国863计划一系列生物信息技术重大研究计划的论证、规划与实施工作；作为我国生物信息学领域的资深专家，有力地推动了我国生物信息技术的发展，并为我国基因组科学、计算机科学等相关领域的发展做出了重要贡献。教育部批准 论著成果 名称 在生物信息学领域顶级期刊《Bioinformatics》、《Nucleic Acids Research》、《Genome Biology》、《Briefings in Bioinformatics》等发表论文近200篇。5篇代表性论文如下： （1）Jiang T, Liu Y, Jiang Y, Li J, Gao Y, Cui Z, Liu Y, Liu B, Wang Y. Long-read-based human genomic structural variation detection with cuteSV. Genome Biol. 2020 Aug 3;21(1):189. doi: 10.1186/s13059-020-02107-y. PMID: 32746918; PMCID: PMC7477834. 学术影响：被国际第三代测序仪厂商Oxford Nanopore Technologies写入技术白皮书，推荐给全球基因组测序用户使用。被基因组科学与生物信息学顶级期刊Nature系列期刊发表的综述论文评价为当前基因组数据分析的代表性算法。 （2）Liu B, Liu Y, Li J, Guo H, Zang T, Wang Y. deSALT: fast and accurate long transcriptomic read alignment with de Bruijn graph-based index. Genome Biol. 2019 Dec 16;20(1):274. doi: 10.1186/s13059-019-1895-9. PMID: 31842925; PMCID: PMC6913027. 学术影响：被国际评价为代表性长读长转录组测序比对分析工具。 （3）Liu B, Guo H, Brudno M, Wang Y. deBGA: read alignment with de Bruijn graph-based seed and extension. Bioinformatics. 2016 Nov 1;32(21):3224-3232. doi: 10.1093/bioinformatics/btw371. Epub 2016 Jul 4. PMID: 27378303. 学术影响：提出基因组序列非线性表示理论及比对方法deBGA，发文时是唯一解决基因组四项关键图理论问题的算法工具。 （4）Juan L, Teng M, Zang T, Hao Y, Wang Z, Yan C, Liu Y, Li J, Zhang T, Wang Y.. The personal genome browser: visualizing functions of genetic variants. Nucleic Acids Res. 2014 Jul;42(Web Server issue):W192-7. doi: 10.1093/nar/gku361. Epub 2014 May 5. PMID: 24799434; PMCID: PMC4086072. 学术影响：在国际上首次建立个人基因组可视化方法与浏览器，广泛应用于基因组可视化工程。 （5）Jiang Q, Wang Y, Hao Y, Juan L, Teng M, Zhang X, Li M, Wang G, Liu Y. miR2Disease: a manually curated database for microRNA deregulation in human disease. Nucleic Acids Res. 2009 Jan;37(Database issue):D98-104. doi: 10.1093/nar/gkn714. Epub 2008 Oct 15. PMID: 18927107; PMCID: PMC2686559. 学术影响：国际代表性基因组非编码RNA与疾病数据库，Google Scholar引用近1500次。 研究团队 名称 团队成员： - 汪国华教授、博士生导师 - 蒋庆华教授、博士生导师 - 刘 博教授、博士生导师 - 李 杰教授、博士生导师 - 赵天意教授、博士生导师 - 胡 杨副教授、博士生导师 - 姜 涛副教授、硕士生导师 - 国宏哲副教授、硕士生导师 - 刘亚东助理教授、硕士生导师 团队主页： 生物信息学研究中心-研究平台 (hit.edu.cn) 研究平台 名称 拥有生物大数据教育部重点实验室 生物信息学研究中心2019年1月获批“生物大数据”教育部重点实验室，成为我国生物大数据核心技术研究国家“战略科技力量”和我国当前最高级别的生物信息学研究机构。 拥有1.5万CPU核、15PB存储资源 生物信息学研究中心计算资源超过1.5万CPU核、数据存储资源超过15PB，可支持实施10万人以上量级的大规模基因组计划，为研究者提供进行世界顶尖生物大数据研究的资源与环境。 拥有PB级基因组大数据研究平台 生物信息学研究中心拥有先进的PB级基因组大数据研究平台，可支持进行针对PB级别基因组数据的的大数据算法与系统研究，为研究者提供迈向世界最高水平大数据算法研究的“阶梯”。 拥有大规模基因组测序中心 生物信息学研究中心拥有以华大智造DNBSEQ-T7型二代测序仪、英国ONT PromethION 48三代测序仪、美国10X Genomics单细胞测序系统等为核心的高通量测序平台，测序能力>10 万人基因组/年。