国宏哲科研成果

基本信息 科学研究 教育教学 新建主栏目 基本信息 名称 博士 硕士生导师 副教授 手机号：15245084413 电子邮箱：hzguo@hit.edu.cn 通讯地址：哈尔滨工业大学科技创新大厦J2007 国宏哲，哈工大计算学部副教授、硕士生导师，国家重点研发计划“中国十万人基因组计划”项目骨干成员，黑龙江省头雁计划成员。主要研究方向：测序数据分析、序列比对与拼接、基因组变异检测、单细胞数据分析、生物大数据安全。在Journal of Infection（IF=38.637）Bioinformatics（IF=6.937）、GPB（IF=9.5）、CIBM（IF=7.7）、TCBB（IF=4.5）和 BMC Bioinformatics（IF=3.307）等生物信息学顶级期刊发表多篇学术论文。主持国家自然科学基金青年项目一项、中国博士后科学基金面上项目一项、国家重点研发计划子课题一项。目前担任Genome Biology、BMC Bioinformatics、IEEE-ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics、Frontiers in Genetics等生物信息学期刊审稿人，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员、黑龙江省计算机学会数据科学与大数据技术专业委员会 每年招收2-3名硕士研究生 欢迎各位同学加入，让我们一起用计算机解码生命遗传信息！ 教育经历 标题 起讫时间 2012.09 – 2019.04 所学专业 计算机应用技术 学习机构 哈尔滨工业大学 学历 博士 简单介绍 2013.09 – 2014.12 美国杜克大学 生物信息学 联合培养博士 标题 起讫时间 2010.09 – 2012.07 所学专业 计算机科学与技术 学习机构 哈尔滨工业大学 学历 硕士 简单介绍 标题 起讫时间 2006.09 – 2010.07 所学专业 生物信息技术 学习机构 哈尔滨工业大学 学历 学士 简单介绍 工作经历 标题 工作单位 哈尔滨工业大学 计算学部 职位/职称 副教授 起讫时间 2024.01-至今 简单介绍 标题 工作单位 哈尔滨工业大学计算学部 职位/职称 师资博士后 讲师 起讫时间 2020.10 - 2023.12 简单介绍 标题 工作单位 星云生物信息技术开发有限公司 职位/职称 高级算法工程师 起讫时间 2019.05 – 2020.08 简单介绍 研究领域 名称 学科领域 计算机科学与技术 主要研究方向 生物信息学 大规模基因组测序数据分析算法研究 DNA存储 学术论文 名称 Hongzhe Guo and Tianyi Zhao. Multiple mutations of IFITM3 are associated with COVID-19 susceptibility. Journal of Infection, 10.1016/j.jinf.2023.02.032, 2023. （IF：38.637；中科院一区期刊） Hongzhe Guo, Liyuan Zhang, Xinran Cui, Liang Cheng, Tianyi Zhao, Yadong Wang, SCancerRNA: Expression at the Single Cell Level and Interaction Resource of Non-coding RNA Biomarkers for Cancers, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2024;, qzae023, https://doi.org/10.1093/gpbjnl/qzae023. （IF：9.5；中科院一区期刊） Hongzhe Guo#, Zhongbo Yang#, Tao Jiang, Shiqi Liu, Yadong Wang* and Zhe Cui*, Evaluation of classification in single cell atac-seq data with machine learning methods, BMC Bioinformatics, 23(5):249-259, 2022.（IF：3.307；中科院二区期刊） Hongzhe Guo#, Yilei Fu, Yan Gao, Junyi Li, Yadong Wang* and Bo Liu*, deGSM: memory scalable construction of large scale de Bruijn Graph, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 18(6):2157-2166, 2021.（IF：3.016；中科院二区期刊；CCF B类期刊） Ping Meng#, Guohua Wang, Hongzhe Guo* and Tao Jiang*, Identifying cancer driver genes using a two-stage random walk with restart on a gene interaction network, Computers in Biology and Medicine, 158(1):106810, 2023. （IF：7.7；中科院一区期刊） Bo Liu#, Hongzhe Guo#, Michael Brudno and Yadong Wang*, deBGA: read alignment with de Bruijn graph-based seed and extension, Bioinformatics, 2016, 32(21): 3224-3232. （共同一作；IF：6.937；中科院一区期刊） Tao Jiang#, Shiqi Liu#, Shuqi Cao, Yadong Liu, Zhe Cui, Yadong Wang* and Hongzhe Guo*, Long-read sequencing settings for efficient structural variation detection based on the comprehensive evaluation, BMC Bioinformatics, 22(1): 552-568, 2021.（通讯作者，IF：3.307；中科院二区期刊） Yadong Liu#, Zhenhao Lu#, Zhongyu Liu, Hongzhe Guo*, Yadong Wang* and Tao Jiang*, Comprehensive evaluation of RNA-seq alignment methods based on long-read sequencing data, 2023 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Istanbul, 2023-12-3至2023-12-5. (CCF B类会议) Hongzhe Guo#, Bo Liu, Dengfeng Guan, Yilei Fu and Yadong Wang*, Fast variation-aware read alignment with deBGA-VARA, 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), Madrid, 2018-12-3至2018-12-6. (CCF B类会议) Tao Jiang#, Shiqi Liu and Hongzhe Guo*. Reply: Correspondence on NanoVar’s performance outlined by Jiang T. et al. in ‘Long-read sequencing settings for efficient structural variation detection based on comprehensive evaluation, BMC Bioinformatics 24, 352 (2023).（通讯作者，IF：3.307；中科院二区期刊） Hongzhe Guo#, Bo Liu#, Dengfeng Guan, Yilei Fu and Yadong Wang*, Fast read alignment with incorporation of known genomic variants. BMC Medical Informatics and Decision Making, 2019, 19(6): 1-13.（IF：3.176；中科院三区期刊） 闫贞磊#, 国宏哲*, 面向大规模人群的基因组注释系统. Chinese Journal of Bioinformatics, 20(1), 2022.（通讯作者，全国中文核心期刊） 科研项目 项目名称 网络生物数据重要性甄别和违规出境检测技术研究 项目来源 国家重点研发计划课题 开始时间 2022.12 结束时间 2025.11 项目经费 315万 担任角色 参与 项目类别 纵向项目 项目状态 进行中 简单介绍 项目名称 基于群体基因组的序列比对与变异检测算法 项目来源 国家自然科学基金委青年项目 开始时间 2023.1 结束时间 2025.12 项目经费 30万 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 进行中 简单介绍 项目名称 大规模人群泛基因组数据分析算法 项目来源 中国博士后科学基金会 开始时间 2022.7 结束时间 2024.1 项目经费 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 进行中 简单介绍 项目名称 大规模中国人群基因组数据开发与利用 项目来源 黑龙江省头雁计划 开始时间 2020.7 结束时间 2023.12 项目经费 976万 担任角色 参与 项目类别 纵向项目 项目状态 进行中 简单介绍 项目名称 大规模人类遗传数据管理、共享、分析平台与关键技术研发 项目来源 国家重点研发计划课题 开始时间 2017.11 结束时间 2021.10 项目经费 517万 担任角色 参与 项目类别 纵向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 中国人群多组学参比数据库与分析系统建设（中国十万人基因组计划） 项目来源 国家重点研发计划 开始时间 2018.1 结束时间 2021.12 项目经费 8950万 担任角色 参与 项目类别 纵向项目 项目状态 完成 简单介绍 招生信息 名称 硕士招生 招生名额： 每年1-2名硕士研究生 研究方向： 生物信息学 大规模基因组测序数据分析算法研究 讲授课程 名称 《C++语言程序设计》：本科生必修课 《C语言程序设计A》：本科生必修课 《生物大数据编程实践》：本科生选修课