王小奇

综合介绍 General Introduction 王小奇博士，现任西北工业大学计算机学院副教授，硕士生导师。湖南大学计算机科学与技术专业博士，主要从事深度学习、生物信息、AI药物发现，数据挖掘等方面的研究，以第一作者在Nature Machine Intelligence (SCI 1区，IF=23.8), Bioinformatics, Briefings in Bioinformatics, IEEE/ACM TCBB, IEEE BIBM等国际顶级期刊/会议发表论文数篇，授权13项发明专利，研发的药物发现平台被评为国家重点研发计划项目亮点成果，源码和数据在国家基因组科学数据中心被下载2200余次，相关研究受到国家自然科学基金委、测序中国等数十家新媒体的报道。作为课题骨干先后参与国家重点研发计划、自然科学基金重点项目等科研项目。 个人相册

教育教学

教育教学 Education and teaching 招生信息 本课题组的研究方向包括深度学习、生物信息学和药物发现，其中药物发现只是本课题的一个应用背景（类似于文本分类，图像分类、推荐系统等），对生物医学的知识没有过多的要求（当然多多益善）。本课题的核心在于数据库的构建、AI算法的设计、系统的开发，具体主要包括：l  核心的技术：自监督学习、多任务学习、提示学习、图神经网络、Transformer、系统开发等；l  面向的数据：药物的1D, 2D和3D结构、生物知识图谱、细胞成像、多组学数据等；l  应用的对象：药物重定位、药物不良反应预测、抗癌药物反应预测、联合用药等。课题组常年招收喜欢科研的本科生（科研项目和毕设）、硕士生，欢迎感兴趣的同学加入，2024年仅剩一个研究生名额，请邮件联系：xqw@nwpu.edu.cn培养模式：l  将根据学生的兴趣和特长进行课题设置和培养，并积极协助优秀学生海外访学、交流、联合培养等；l  亲自带着学生阅读论文，指导具体的设计方案、程序开发，实验设计、论文撰写、专利申请等；l  针对学生发表的不同层次的论文和专利，提供额外的科研奖励，并资助表现优异的同学参加国内外学术会议；招生备注：虽然有类似的项目经验很重要，但是相比于学生的能力与基础，我更看重学生对科研的态度以及是否有毅力坚持下去。

荣誉获奖

科研成果 Scientific research results 论文成果 [1] Xiaoqi Wang, Yingjie Cheng, Yaning Yang, Yue Yu, Fei Li, Shaoliang Peng. Multitask joint strategies of self-supervised representation learning on biomedical networks for drug discovery. Nature Machine Intelligence (SCI 1区，IF=23.80), 2023,5,445-456 [2] Xiaoqi Wang, Bin Xin, Weihong Tan, Zhijian Xu, Kenli Li, Fei Li, Wu Zhong, Shaoliang Peng. DeepR2cov: deep representation learning on heterogeneous drug networks to discover anti-inflammatory agents for COVID-19. Briefings in Bioinformatics (CCF B), 2021,22,bbab226 [3] Xiaoqi Wang, Yaning Yang, Kenli Li, Wentao Li, Fei Li, Shaoliang Peng. BioERP: biomedical heterogeneous network-based self-supervised representation learning approach for entity relationship predictions. Bioinformatics (CCF B), 2021,37,4793-4800 [4] Hong Wang#, Xiaoqi Wang#, Wenjuan Liu, Xiaolan Xie, Shaoliang Peng. deepDGA: biomedical heterogeneous network-based deep learning framework for disease-gene association predictions (共同第一作者). IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (CCF B), 2022 [5] GuiJun Zhang, Xiaoqi Wang, Laifa Ma, Liu-Jing Wang, Jun Hu, Xiao-Gen Zhou. Two-stage Feature-based Optimization Algorithm for De Novo Protein Structure Prediction. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (CCF B), 2020,17,2119-2130

科学研究

获奖信息 The winning information [1] 2019年浙江省优秀硕士学位论文奖[2] 第十六届“挑战杯”全国大学生课外学术科技竞赛-全国二等奖[3] 第八届中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛-全国银奖

学术成果

团队信息 Team Information 大数据管理与存储 工业与信息化部重点实验室 ，负责人：李战怀教授数据挖掘和生物信息实验室，负责人：尚学群教授/院长

综合介绍