孙东昌

个人简介 教授，博士生导师，美国微生物学会“Young Investigator”，法国图卢兹第三大学微生物学博士，加拿大英属哥伦比亚大学访问学者，中国微生物学会会员，中国遗传学会会员，中国化工学会会员，浙江省高校中青年学科带头人，浙江省微生物学会青委会副主任委员，研究方向为CRISPR基因编辑与微生物制药，开展CRISPR调控基础与应用研究，开发产活性代谢产物的高版本微生物底盘细胞，先后主持国家自然科学基金3项、省级项目3项和重大横向项目，任法国国家科研署（ANR）项目评审专家、波兰/中国自然科学基金评审专家、苏黎世联邦理工学院学科带头人专项通讯评审专家、教育部研究生学位论文评审专家，通讯/第一作者在Biotechnol Adv、ACS Synth Biol、Appl Env Microbiol、J Bacteriol、J Antimicrob Chemoth、Appl Microbiol Biotechnol等主流期刊上发表科研论文20余篇，第一发明人授权国家发明专利3项。任Front Microbiol期刊编委，mSphere、Synth Syst Biotechnol 、Biotechnol J、Appl Biochem Biotechnol等SCI期刊论文评审专家，入选浙江工业大学青年英才支持计划，获浙江工业大学优秀教师、优秀班主任、优秀本科生导师等荣誉称号，指导研究生获中国微生物学会2020年度和2023年度学术年会优秀学术报告奖，指导本科生参加iGEM大赛获金奖，指导研究生/本科生获校级优秀学位论文多次。 教学与课程 一、主讲课程1. 研究生课程《生物技术前沿》2. 本科生课程《微生物学实验》二、主持教改项目1.微生物学技术双语课程教学体系的探索与实践（2017205）（已结题）2.面向留学生的《微生物学实验》全英文课程教改与实践（JG201733）（已结题）三、教改论文和教材1. 孙东昌. 通过现代微生物学技术课程教学培养研究生创新能力的实践[J]. 生物工程学报, 2021, 37(4):7.2.钟卫鸿，汪琨，裘娟萍，余志良，吕镇梅，杨胜利，赵春田，孙东昌，黄海婵. 微生物学数字课程. 高等教育出版社. 2020. 育人成果 育人成果1. 指导学生参加国际基因工程大赛获金奖2. 指导学生参加全国生命科学创新创业大赛获三等奖3. 指导学生立项浙江省新苗计划4. 指导学生获校级优秀硕士毕业论文和本科毕业论文5. 指导研究生获“2020年中国微生物学会学术年会”、“2023年中国微生物学会学术年会”优秀学术交流奖6. 指导研究生多次获浙江省微生物学会学术交流奖7. 作为班主任管理的班级获“校级先进班级”称号8. 获浙江工业大学“优秀青年教师”、“优秀班主任”、“优秀本科生导师”、“年度优秀教师”等称号9. 指导的研究生/本科生赴法国巴黎萨克雷大学、美国西北大学、日本东京大学、浙江大学、山东大学、厦门大学等国内外一流高校深造。 科研项目 主持科研项目1. 转录因子LeuO激活适应性免疫系统CRISPR/Cas防御大肠杆菌自然转化的机制，国家自然科学基金面上项目，2022-2025，58万元 2. StpA 调控自然感受态大肠杆菌中CRISPR/Cas 系统的机制研究，国家自然科学基金面上项目，2017-2020，62 万元3.质粒双链DNA转移导致细菌耐药的分子基础和调控机制，国家自然科学基金青年项目，2012-2014，22 万元4.新型兽药研制及耐药性控制技术研发—动物源细菌耐药性检测与控制技术研究开发，浙江省重点研发计划课题，2020-2022，50万元/285万元5. 多粘菌素生产菌多粘类芽孢杆菌C12遗传重组机制研究，浙江省自然科学基金委，2016-2018，10万元6. 抗性基因转移导致细菌耐药的防控研究，浙江省自然科学基金委，2011-2013，10万元7. 企业重大横向，2021-2025，700万元 科研成果 一、代表性论文（*通讯作者） 1. Yuan P*, Xu M, Mao C, Zheng H, Sun D*. 2023. Dynamically regulating glucose uptake to reduce overflow metabolism with a quorum-sensing circuit for the efficient synthesis of d-pantothenic acid in Bacillus subtilis. ACS Synth Biol. 12(10):2983-2995. DOI 10.1021/acssynbio.3c00315. (博士后一作，IF: 4.7, 中科院TOP期刊)2. Yu M, Hu S, Tang B, Yang H, Sun D*. 2023. Engineering Escherichia coli Nissle 1917 as a microbial chassis for therapeutic and industrial applications. Biotechnol Adv. 67:108202. DOI: 10.1016/j.biotechadv.2023.108202.  (研究生一作, IF: 16；中科院TOP期刊)3. Sun D*, Sun X*, Hu Y*, Yamaichi Y*. 2023. Editorial: Horizontal gene transfer mediated bacterial antibiotic resistance, volume II. Front Microbiol. 14:1221606. doi: 10.3389/fmicb.2023.1221606 ( IF: 5, 中科院TOP期刊)4. Hu S, Fei M, Fu B, Yu M, Yuan P, Tang B, Yang H. Sun D*. 2023. Development of probiotic E. coli Nissle 1917 for β‑alanine production by using protein and metabolic engineering. Appl Microbiol Biotechnol. 107(7-8): 2277-2288（研究生一作， IF: 5, 中科院TOP期刊）5. Chen Z, Shen M, Mao C, Wang C, Yuan P, Wang T, Sun D*. 2021. A type I restriction-modification system influences genomic evolution driven by horizontal gene transfer in Paenibacillus polymyxa. Front Microbiol. 12: 709571. DOI：10.3389/fmicb.2021.709571 （研究生一作， IF: 5, 中科院TOP期刊）6. Sun D*, Mao X, Fei M, Chen Z, Zhu T, Qiu J. 2020. Histone-like nucleoid-structuring protein (H-NS) paralogue StpA activates the type I-E CRISPR-Cas system against natural transformation in Escherichia coli. Appl Environ Microbiol. 86:e00731-20. DOI：10.1128/AEM.00731-20 (IF: 4.3，中科院TOP期刊)7. Fei M，Mao X，Chen Y，Lu Y ，Wang L，Yang J ，Qiu J，Sun D*. 2020. Development of a dual-fluorescence reporter system for high-throughput screening of L-aspartate-a-decarboxylase. Acta Bioch Bioph Sin. 52(12):1420-1426. DOI: 10.1093/abbs/gmaa134 （研究生一作， IF: 3.7）8. Sun D*, Jeannot K*, Xiao YH*, Knapp CW*. 2019. Editorial: horizontal gene transfer mediated bacterial antibiotic resistance. Front Microbiol. 10:1933. DOI: 10.3389/fmicb.2019.01933 (IF: 5, 中科院TOP期刊)9. Sun D. 2018. Pull in and push out: mechanisms of horizontal gene transfer in bacteria. Front Microbiol 9:2154. DOI: 10.3389/fmicb.2018.02154 (IF: 5, 中科院TOP期刊)10. Shen M, Chen Z, Mao X, Wang L, Liang J, Huo Q, Yin X, Qiu J, Sun D*. 2018. Two different restriction-modification systems for degrading exogenous DNA in Paenibacillus polymyxa. Biochem Biophys Res Commun 504:927-932. DOI: 10.1016/j.bbrc.2018.09.016. （研究生一作,  IF: 3.1）11. Sun D. 2016. Two different routes for double-stranded DNA transfer in natural and artificial transformation of Escherichia coli. Biochem Biophys Res Commun 471:213-8. DOI：10.1016/j.bbrc.2016.01.137. （IF: 3.1）12. Wang B, Sun D*. 2015. Detection of NDM-1 carbapenemase-producing Acinetobacter calcoaceticus and Acinetobacter junii in environmental samples from livestock farms. J Antimicrob Chemother 70:611-3. DOI：10.1093/jac/dku405 （IF: 5.2，中科院TOP期刊）13. 卢亚兰,唐标,杨华,孙东昌*.CRISPR-Cas系统转录调控机制的研究进展.微生物学报,2022,62(4):1308-1321. DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20210504 （研究生一作）14. 王晨羽,刘芝芝,唐标,杨华,孙东昌*.利用CRISPR-Cas系统防控细菌耐药性的研究进展[J].生物工程学报,2022,38(4):1432~1445. DOI: 10.13345/j.cjb.210348 （研究生一作） 二、授权发明专利1. 一种穿梭质粒载体及其构建方法和应用，ZL201710873809.9，第一发明人，2020 （授权）2. 一种双荧光筛选β-丙氨酸合成酶的方法，ZL201910071013.0，第一发明人，2022 （授权）3.  β丙氨酸合成酶突变体、编码基因、基因工程菌及应用，ZL201710873809.9，第一发明人，2022 （授权）4. 一种高产β-丙氨酸的工程菌及其应用，2022110297108，第一发明人，2022 （受理）5. 一种高产D-泛酸的益生工程菌及其在产D-泛酸和制备益生菌添加剂中的应用，2023102905322，第一发明人，2023 （受理）6. 一种靶向识别切割多耐药基因的EcN工程菌及其构建方法与应用，2023107976339，第一发明人，2023 （受理）7. 一种基于I型CRISPR-Cas系统的优化型基因表达调控工具及应用，第一发明人，2023083101329010，2023 （受理） 社会服务 社会服务1. 法国国家科研署（ANR）项目评审专家2. 波兰国家自然科学基金评审专家3. 苏黎世联邦理工学院学科带头人专项通讯评审专家4. 国家自然科学基金同行评审专家5. 教育部研究生学位论文评审专家6. Front Microbiol期刊特邀副编辑7. mSphere、Synth Syst Biotechnol、Biotechnol J、Appl Biochem Biotechnol等期刊论文审稿人8. 浙江省微生物学会青年委员会副主任委员