吴琼

基本信息 科学研究 论文专著 教育教学 新建主栏目 基本信息 名称 工作经历 名称 1992年9月～1996年6月哈尔滨工业大学医院外科医师1996年6月～1997年6月日本名古屋市立大学病理研究员2003年3月～2006年12月日本东京农业大学发育生物学研究员2006年4月～至今哈尔滨工业大学发育生物学教授 教育经历 名称 1987年9月～1992年7月哈尔滨医科大学临床医学学士1997年6月～1998年3月日本国立新泻大学生物研究生1998年4月～2000年3月日本国立新泻大学生体机能专攻硕士2000年4月～2003年3月日本国立新泻大学生物圈科学博士 研究领域 名称 非编码RNA的功能分析 基于基因编辑技术的超级增强子功能研究 表观遗传学（基因组印记机制，DNA甲基化） 环境因素的表观遗传学效应及健康风险评价 奖项成果 名称 2013年度 黑龙江省高校科学技术奖 一等奖 2013年度黑龙江省科学技术奖 三等奖（自然） 2017年度 黑龙江省高校科学技术奖 二等奖 2017年度 黑龙江省科学技术奖 二等奖（自然） 主要任职 名称 中国细胞生物学学会 常务理事 黑龙江省细胞生物学会 理事长 《中国细胞生物学学报》编委 《生物技术》committee member 科研项目 项目名称 Dlk1-Dio3印记区域内母本甲基化差异甲基化区Meg8-DMR的功能研究 项目来源 国家自然基金面上项目 开始时间 2018-01-01 结束时间 2021-12-31 项目经费 60 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 进行中 简单介绍 项目名称 mir-341、mir-1188、mir-370 在小鼠发育中的表达与调控机制的研究 项目来源 国家自然科学基金 开始时间 2010-01-01 结束时间 2012-12-01 项目经费 32 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 印记基因的机器学习方法预测及候选印记基因的实验鉴定 及功能分析 项目来源 国家自然科学基金 开始时间 2012-01-01 结束时间 2015-12-01 项目经费 55 担任角色 负责 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 基于RNA-seq数据识别胚胎发育相关的lncRNA及新候选lncRNA的鉴定机功能研究 项目来源 国家自然科学基金 开始时间 2014-01-01 结束时间 2017-12-01 项目经费 80 担任角色 负责 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 特定的转录因子重组蛋白诱导成纤维细胞直接重编程软骨细胞及其安全性的研究 项目来源 国家自然科学基金 开始时间 2013-01-01 结束时间 2016-12-01 项目经费 80 担任角色 参与 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 长非编码RNA Rian/Irm在小鼠骨骼肌发育中的功能研究 项目来源 国家自然科学基金 开始时间 2013-01-01 结束时间 2013-12-01 项目经费 15 担任角色 参与 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 小鼠1号染色体新印记基因的鉴定及差异甲基化区分析 项目来源 国家自然科学基金(青年) 开始时间 2012-01-01 结束时间 2014-12-01 项目经费 25 担任角色 参与 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 DLK1-Dio3印记簇长非编码RNA在小鼠早期胚胎发育中的功能研究 项目来源 国家自然科学基金（青年） 开始时间 2013-01-01 结束时间 2015-08-01 项目经费 24 担任角色 参与 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 小鼠锌指蛋白CTCF对印记表达的mir-341、 mir-118的调控机制的研究 项目来源 国家自然科学基金（青年） 开始时间 2012-01-01 结束时间 2014-12-01 项目经费 22 担任角色 参与 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 关于改善重组蛋白质诱导iPS细胞效率的研究 项目来源 国家自然科学基金 开始时间 2011-01-01 结束时间 2011-12-01 项目经费 10 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 纳米二氧化硅（SiO2）对小鼠生殖系统的表观遗传学效应 项目来源 黑龙江省自然科学基金 开始时间 2012-10-01 结束时间 2014-12-01 项目经费 5 担任角色 负责 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 小鼠12号染色体新印记基因的分离、印记鉴定及其DMR分析 项目来源 黑龙江省自然科学基金 开始时间 2011-01-01 结束时间 2013-12-01 项目经费 5 担任角色 参与 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 microRNA gene Mirg的表达与调控机制的研究 项目来源 黑龙江省留学回国人员科技项目择优资助资金 开始时间 2008-10-01 结束时间 2011-12-01 项目经费 5 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 印记基因Rian的表达与调控机制的研究 项目来源 教育部留学归国人员科研启动基金 开始时间 2008-08-01 结束时间 2009-08-01 项目经费 2.5 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 miR370在小鼠胚胎发育及肿瘤细胞中的功能研究 项目来源 中国博士后科学基金 开始时间 2012-01-01 结束时间 2014-12-01 项目经费 5 担任角色 参与 项目类别 横向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 环境雌激素对小鼠生殖系统的表观遗传学效应 项目来源 国家重点实验室自主课题 开始时间 2010-07-01 结束时间 2012-06-01 项目经费 10 担任角色 负责 项目类别 纵向项目 项目状态 完成 简单介绍 项目名称 项目来源 开始时间 结束时间 项目经费 担任角色 项目类别 项目状态 简单介绍 项目名称 项目来源 开始时间 结束时间 项目经费 担任角色 项目类别 项目状态 简单介绍 研究领域 名称 发育生物学 表观遗传学 研究方向及简要说明1. 基因组的印记机制：主要研究哺乳动物的基因组的印记机制。包括CpG岛的预测及DNA甲基化分析；发育关联的新印记基因的预测、鉴定、分离及功能分析；通过转基因和基因敲除技术进行模式动物的制作，研究正常及孤雌生殖的发育机制等。2. 非编码RNA的功能分析：分离鉴定控制哺乳动物生殖细胞、胚胎及其干细胞发育的非编码RNA；建立非编码RNA的功能研究教学平台，阐明一批关键非编码RNA在生殖发育、干细胞发育等过程中的控制网络和信号传导途径；筛选出潜在的药物靶点蛋白。3. 基因编辑:主要研究内容是利用CRISPR技术，进行疾病关联基因、肿瘤特异性的超级增强子及发育关联的差异甲基化调控区等的编辑工作。并利用显微注射技术构建动物模型，研究其功能。4. 环境激素的表观遗传学效应及健康风险评价: 主要研究由环境雌激素导致的小鼠生殖系统异常，并通过异常表达的基因，及其DNA甲基化、组蛋白乙酰化等表观遗传学分 析，以期探索环境雌激素所导致的生殖系统的表观遗传学改变。并对暴露人群的健康影响作出客观的评价。 团队成员 名称 见研究室网页：http://202.97.205.78/wu 论文期刊 论文标题 Meg8-DMR as the Secondary Regulatory Region Regulates the Expression of MicroRNAs While It Does Not Affect Embryonic Development in Mice 作者 Liang Zhang 1 , Zhengbin Han 1 , Hongjuan He 1 , Ximeijia Zhang 1 , Mengyan Zhang 1 , Boran Li 1 , Qiong Wu 1 2 发表时间 2023 Jun 14 期刊名称 Genes (Basel) . 期卷 14(6):1264 简单介绍 论文标题 N4-acetylcytidine of Nop2 mRNA is required for the transition of morula-to-blastocyst 作者 Mengyun Wang # 1 , Rui Cheng # 2 , Hongjuan He 1 , Zhengbin Han 3 , Yan Zhang 4 , Qiong Wu 5 发表时间 2023 Sep 期刊名称 Cell Mol Life Sci . 期卷 28;80(10):307. 简单介绍 论文标题 CpG_MPs: identification of CpG methylation patterns of genomic regions from high-throughput bisulfite sequencing data 作者 Su, Jianzhong, Yan, Haidan, Wei, Yanjun, Liu, Hongbo, Liu, Hui, Wang, Fang, Lv, Jie, Wu, Qiong, Zhang, Yan 发表时间 期刊名称 Nucleic Acids Research 期卷 41(1), 201 简单介绍 论文标题 Expression and Imprinting Analysis of AK044800, a Transcript from the Dlk1-Dio3 Imprinted Gene Cluster During Mouse Embryogenesi 作者 Zhengbin Han, Qi Liu, Zhijun Huang, Wei Cui, Yijun Tian, Weili Yan, and Qiong Wu* 发表时间 期刊名称 Mol. Cells 期卷 35, 1-10, 简单介绍 论文标题 miR-370 is stage-specifically expressed during mouse embryonic 4 development and regulates Dnmt3a 作者 Liu Qi, He Hongjuan, Gu Ning, Han Zhengbin, Xing Yanjiang, Zeng Tiebo, Huang Zhijun, Wu Qiong ？ 发表时间 期刊名称 FEBS Letters 期卷 587 (2013) 简单介绍 论文标题 Genome-wide identification of Polycomb target genes in human embryonic 2 stem cells 作者 Xue Xiao a, Zhe Li b, Hongbo Liu a, Jianzhong Su a, Fang Wang a, Xueting Wu a, Hui Liu a, 4 Qiong Wu c, Yan Zhang a 发表时间 期刊名称 GENE 期卷 38149 简单介绍 论文标题 Expression profile of mouse Mterfd2, a novel component of the mitochondrial transcription termination factor (MTERF) family. 作者 Xu Q, Zhang F, He H, Xu S, Li K, Liu S, Li Y, Wu Q.* 发表时间 期刊名称 Genet Syst. 期卷 86(4):269- 简单介绍 论文标题 DiseaseMeth: a human disease methylation database 作者 Jie Lv1,2, Hongbo Liu1, Jianzhong Su1, Xueting Wu1, Hui Liu1, Boyan Li1, Xue Xiao1,Fang Wang1, Qiong Wu2,* and Yan Zhang1,* 发表时间 期刊名称 NUCLEIC ACIDS RESEARCH 期卷 40期: D1 页 简单介绍 论文标题 Conservation of genomic imprinting at the NDN, MAGEL2 and MEST loci in pigs 作者 Zhang FW, Han ZB, Deng CY, He HJ, Wu Q* 发表时间 期刊名称 Genes Genet Syst 期卷 87(1):53-8 简单介绍 论文标题 Expression patterns of ubiquitin conjugating enzyme UbcM2 during mouse embryonic development. 作者 Xing Yanjiang, He Hongjuan, Gu Tiantian, Zhang Yan, Huang Zhijun, Wu Qiong* 发表时间 期刊名称 Gene expression 期卷 15(4):163- 简单介绍 论文标题 Expression of macro non-coding RNAs Meg8 and Irm in mouse embryonic development 作者 Gu, Tiantian, He, Hongjuan, Han, Zhengbin, Zeng, Tiebo, Huang, Zhijun, Liu, Qi, Gu, Ning, Chen, Yan, Sugimoto, Kenkichi, Jiang 发表时间 期刊名称 Acta Histochemica 期卷 简单介绍 论文标题 Spatiotemporal expression pattern of Mirg, an imprinted non-coding gene, during mouse embryogenesis. 作者 Han Z, He H, Zhang F, Huang Z, Liu Z, Jiang H, Wu Q.* 发表时间 期刊名称 J Mol Histol. 期卷 简单介绍 论文标题 Identification and Characterization of Long Non-coding RNAs Related to Mouse Embryonic Brain Development From Available Transcri 作者 Jie Lv,Wei Cui,Hongbo Liu, Hongjuan He, Youcheng Xiu, Jing Guo, Hui Liu, Qi Liu, Tiebo Zeng, Yan Chen, Yan Zhang, Qiong Wu * 发表时间 期刊名称 Plos one 期卷 接收 简单介绍 论文标题 Expression analysis of AK003491, an imprinted noncoding RNA, during mouse development. 作者 Zeng TB, He HJ, Zhang FW, Han ZB, Huang ZJ, Liu Q, Wu Q.* 发表时间 期刊名称 Genes Genet Syst. 期卷 简单介绍 论文标题 Long non-coding RNA identification over mouse brain development by integrative modeling of chromatin and genomic features. 作者 Lv, Jie; Liu, Hongbo; Huang, Zhijun; Su, Jianzhong; He, Hongjuan; Xiu, Youcheng; Zhang, Yan..; Wu, Qiong* 发表时间 期刊名称 Nucleic Acids Research 期卷 2013 Dec 1 简单介绍 论文标题 Quantitative epigenetic co-variation in CpG islands and co-regulation of developmental genes 作者 Hongbo Liu , Yanjun Chen , Jie Lv , Hui Liu , Rangfei Zhu , Jianzhong Su , Xiaojuan Liu , Yan Zhang, Qiong Wu* 发表时间 期刊名称 Scientific Reports 期卷 已接收 简单介绍 论文标题 Neural-specific expression of miR-344-3p during mouse embryonic development. 作者 Liu Q, He H, Zeng T, Huang Z, Fan T, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 J Mol Histol. 期卷 [Epub ahea 简单介绍 论文标题 Dynamic expression pattern of Pde4d and its relationship with CpG methylation in the promoter during mouse embryo development. 作者 Huang Z, Han Z, Cui W, Zhang F, He H, Zeng T, Sugimoto K, Wu Q* 发表时间 期刊名称 Biochem Biophys Res Commun. 期卷 2013 Nov 2 简单介绍 论文标题 EpiDiff: Entropy-based quantitative identification of differential epigenetic modification regions from epigenomes. 作者 Zhang Y, Su J, Yu D, Wu Q, Yan H. 发表时间 期刊名称 Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 期卷 2013 Jul;2 简单介绍 论文标题 Role of FGF10 on tumorigenesis by MS-K. 作者 Sugimoto K, Yoshida S, Mashio Y, Toyota N, Xing Y, Xu H, Fujita Y, Huang Z, Touma M, Wu Q. 发表时间 期刊名称 Genes Cells. 期卷 [Epub ahe 简单介绍 论文标题 DevMouse, the mouse developmental methylome database and analysis tools. 作者 Liu H, Zhu R, Lv J, He H, Yang L, Huang Z, Su J, Zhang Y, Yu S, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 Database (Oxford). 期卷 2014:bat08 简单介绍 论文标题 Spatiotemporal expression of retrogene-host pair Mcts2/H13 in mouse embryo, and Mcts2 has no influence on H13 transcription patt 作者 Huang Z, Han Z, Zhang F, He H, Yu S, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 Acta Histochem. 期卷 2014 Mar;1 简单介绍 论文标题 MetaImprint: an information repository of mammalian imprinted genes. 作者 Wei Y, Su J, Liu H, Lv J, Wang F, Yan H, Wen Y, Liu H, Wu Q*, Zhang Y*. 发表时间 期刊名称 Development 期卷 Epub ahead 简单介绍 论文标题 Identification and characterization of long intergenic non-coding RNAs related to mouse liver development 作者 Lv J, Huang Z, Liu H, Liu H, Cui W, Li B, He H, Guo J, Liu Q, Zhang Y, Wu Q.* 发表时间 期刊名称 Mol Genet Genomics. 期卷 简单介绍 论文标题 Identification of 4438 novel lincRNAs involved in mouse pre-implantation embryonic development. 作者 Lv J, Liu H, Yu S, Liu H, Cui W, Gao Y, Zheng T, Qin G, Guo J, Zeng T, Han Z, Zhang Y, Wu Q* 发表时间 期刊名称 Mol Genet Genomics 期卷 290卷, pp 6 简单介绍 论文标题 DNA methylation dynamics of a maternally methylated DMR in the mouse Dlk1-Dio3 domain. 作者 Zeng TB, He HJ, Han ZB, Zhang FW, Huang ZJ, Liu Q, Cui W, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 FEBS Lett. 期卷 2014 Dec 2 简单介绍 论文标题 MiR-1188 at the imprinted Dlk1-Dio3 domain acts as a tumor suppressor in hepatoma cells. 作者 Cui W, Huang Z, He H, Gu N, Qin G, Lv J, Zheng T, Sugimoto K, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 Mol Biol Cell. 期卷 26(8):141 简单介绍 论文标题 Chromatin modifications and genomic contexts linked to dynamic DNA methylation patterns across human cell types. 作者 Yan H, Zhang D, Liu H, Wei Y, Lv J, Wang F, Zhang C, Wu Q, Su J, Zhang Y. 发表时间 期刊名称 Sci Rep. 期卷 2015 Feb 1 简单介绍 论文标题 Expression patterns of long noncoding RNAs from Dlk1-Dio3 imprinted region and the potential mechanisms of Gtl2 activation durin 作者 Han Z, Yu C, Tian Y, Zeng T, Cui W, Mager J, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 Biochem Biophys Res Commun. 期卷 2015 May 2 简单介绍 论文标题 Preclinical optimization of a broad-spectrum anti-bladder cancer tri-drug regimen via the Feedback System Control (FSC) platform 作者 Liu Q, Zhang C, Ding X, Deng H, Zhang D, Cui W, Xu H, Wang Y, Xu W, Lv L, Zhang H, He Y, Wu Q, Szyf M, Ho CM, Zhu J. 发表时间 期刊名称 Sci Rep. 期卷 2015 Jun 1 简单介绍 论文标题 Identification and Epigenetic Analysis of a Maternally Imprinted Gene Qpct. 作者 Guo J, He H, Liu Q, Zhang F, Lv J, Zeng T, Gu N, Wu Q* 发表时间 期刊名称 Mol Cells. 期卷 Epub ahead 简单介绍 论文标题 Systematic identification and annotation of human methylation marks based on bisulfite sequencing methylomes reveals distinct ro 作者 Liu H 发表时间 期刊名称 Nucleic Acids Res. 期卷 2016 Jan 8 简单介绍 论文标题 SEA: a super-enhancer archive. 作者 Wei Y 发表时间 期刊名称 Nucleic Acids Res. 期卷 2016 Jan 4 简单介绍 论文标题 Inhibition of blood vessel formation in tumors by IL-18-polarized M1 macrophages. 作者 Xing Y 发表时间 期刊名称 Genes Cells. 期卷 2016 Jan 2 简单介绍 论文标题 Aquaporin-1, a New Maternally Expressed Gene, Regulates Placental Development in the Mouse. 作者 Guo J, He H, Liu H, Liu Q, Zhang L, Liu B, Sugimoto K, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 Biol Reprod. 期卷 Epub ahead of print 简单介绍 论文标题 Target Delivery of a Novel Antitumor Organoplatinum(IV)-Substituted Polyoxometalate Complex for Safer 作者 Sun T, Cui W, Yan M, Qin G, Guo W, Gu H, Liu S*, Wu Q*. 发表时间 期刊名称 Adv Mater. 期卷 Epub ahead of print 简单介绍 论文标题 Computational identification of putative lincRNAs in mouse embryonic stem cell. 作者 Liu H, Lyu J, Liu H, Gao Y, Guo J, He H, Han Z, Zhang Y, Wu Q. 发表时间 期刊名称 Sci Rep. 期卷 简单介绍 论文标题 Highly fluorescent hyperbranched BODIPY-based conjugated polymer dots for cellular imaging. 作者 Du R, Cui S, Sun Z, Liu M, Zhang Y, Wu Q, Wu C, Guo F, Zhao L. 发表时间 期刊名称 Chem Commun (Camb). 期卷 简单介绍 论文标题 EphA2 super-enhancer promotes tumor progression by recruiting FOSL2 and TCF7L2 to activate the target gene EphA2 作者 Shuang Cui , Qiong Wu * , Ming Liu , Mu Su , ShiYou Liu , Lan Shao , Xiao Han , Hongjuan He * 发表时间 2021 期刊名称 Cell Death Dis . 期卷 12;12(3):264 简单介绍 论文标题 Baicalin inhibits breast cancer development via inhibiting I？B kinase activation in vitro and in vivo 作者 YANG GAO1*, HUI LIU1*, HONGZHI WANG2*, HAILONG HU1, HONGJUAN HE, NING GU, XIAO HAN, QIAN GUO, DONG LIU, SHUANG CUI, HONGJIANG SHAO, CHENGJUN JIN and QIONG WU* 发表时间 期刊名称 INTERNATIONAL JOURNAL OF ONCOLOGY 期卷 53: 2727-2736 简单介绍 论文标题 EphA2 super-enhancer promotes tumor progression by recruiting FOSL2 and TCF7L2 to activate the target gene EphA2 作者 Shuang Cui 1 , Qiong Wu 2 , Ming Liu 1 , Mu Su 1 , ShiYou Liu 1 , Lan Shao 1 , Xiao Han 1 , Hongjuan He 发表时间 2021 Ma 期刊名称 Cell Death and Disease 期卷 (2021)12:264 简单介绍 论文标题 Identification of a Five-miRNA Signature for Diagnosis of Kidney Renal Clear Cell Carcinoma. 作者 Zhao E, Li X, You B, Wang J, Hou W, Wu Q. 发表时间 2022 Apr 期刊名称 Front Genet. 期卷 20;13:857411. 简单介绍 论文标题 m6A methylated EphA2 and VEGFA through IGF2BP2/3 regulation promotes vasculogenic mimicry in colorectal cancer via PI3K/AKT and ERK1/2 signaling. 作者 Liu X, He H, Zhang F, Hu X, Bi F, Li K, Yu H, Zhao Y, Teng X, Li J, Wang L, Zhang Y, Wu Q. 发表时间 2022 May 期刊名称 Cell Death Dis. 期卷 21;13(5):483. 简单介绍 论文标题 Deletion of Meg8-DMR Enhances Migration and Invasion of MLTC-1 Depending on the CTCF Binding Sites. 作者 Han, Xiao; He, Hongjuan; Shao, Lan; Cui, Shuang; Yu, Haoran; Zhang, Ximeijia; Wu, Qiong* 发表时间 2022 Aug 期刊名称 International Journal of Molecular Sciences 期卷 2022, 23(15):8828 简单介绍 出版物 出版物名称 计算生物学 作者 副主编 出版时间 2023年9月 出版社 科学出版社 简单介绍 出版物名称 小鼠发育生物学实验 作者 主编：吴琼 出版时间 2015年12月 出版社 哈尔滨工业大学出版社 简单介绍 论文期刊 论文标题 A Novel Approach to Identify Enhancer lincRNAs by Integrating Genome, Epigenome, and Regulatome 作者 Hui Liu 1 , Tiantongfei Jiang 1 , Shuyuan Wang 1 , Xiang Chen 1 , Xiaoyan Jin 1 , Qi Wang 1 , Xinhui Li 1 , Jiaqi Yin 1 , Tingting Shao 1 , Yongsheng Li 1 2 , Juan Xu 1 2 , Qiong Wu 3 发表时间 2019 期刊名称 Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 期卷 7: 427. 简单介绍 讲授课程 名称 生命科学导论 创新研修课：印记基因的鉴定和功能分析 生命科学基础与应用 表观遗传学 招生信息 名称 暂无填写